El Centro Población y Desarrollo fue creado en 1988 gracias a la iniciativa del Ministerio de la Cooperación, con el fin de garantizar una mejor coordinación de las acciones de Francia en este ámbito. Definido como Agrupación de interés científico (GIS), fue dirigido sucesivamente por Francis Gendreau (IRD), Jacques Vallin (INED), Alain Léry (INSEE) y André Quesnel (IRD).
En 2008, el GIS CEPED se transformó en una Unidad Mixta de Investigación (UMR) para adaptarse a las reconfiguraciones del panorama de la investigación y de las universidades francesas, asociando desde entonces la Universidad París Descartes, el IRD y el INED.
Desde 2015, el INED no esta asociada al Ceped.
Yves Charbit fue designado por la Universidad París Descartes, el IRD y el INED como director de esta UMR entre 2008 y 2013. Su sucesor es Etienne Gerard a partir del 1 de enero de 2014.