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prevR

estimation spatiale à partir des EDS

prevR fournit des fonctions pour l’estimation spatiale d’une surface de prévalences ou d’une surface de risques relatifs à partir de données issues d’une Enquête Démographique et de Santé (EDS) ou d’une enquête analogue.

prevR se présente sous la forme d’un package additionnel pour le logiciel de statistiques libre et gratuit R (http://www.r-project.org/). Il permet d’importer les données, de les formater, puis de cartographier les tendances régionales d’une prévalence. Les résultats peuvent ensuite être exportés vers d’autres logiciels de statistiques ou des logiciels de cartographie.

prevR a été développé par Joseph Larmarange avec l’appui financier de l’ANRS (Agence Nationale de Recherche sur le Sida et les hépatites virales) et de l’IRD (Institut de Recherche pour le Développement, en collaboration avec le Centre Muraz au Burkina Faso.

prevR est distribué sous la licence CeCILL-C [1].

Les méthodologies implémentées dans prevR ont été décrites dans

  • Larmarange Joseph, Vallo Roselyne, Yaro Seydou, Msellati Philippe, Méda Nicolas (2011). “Méthodes pour cartographier les tendances régionales de la prévalence du VIH à partir des Enquêtes Démographiques et de Santé (EDS)”, Cybergeo  : European Journal of Geography, 539 (http://cybergeo.revues.org/23782), RIS, BibTeX.
  • Larmarange Joseph, Vallo Roselyne, Yaro Seydou, Msellati Philippe, Méda Nicolas (2011). “Methods for mapping regional trends of HIV prevalence from Demographic and Health Surveys (DHS)”, Cybergeo  : European Journal of Geography, 558, doi: 10.4000/cybergeo.24606 (http://cybergeo.revues.org/24606), RIS, BibTeX.

Téléchargement et installation

prevR a été entièrement réécrit afin de produire une version 2 plus facile d’utilisation et offrant plus de possibilités.

prevR est désormais disponible sur CRAN. Pour l’installer, il vous suffit d’utiliser la commande Packages > Installer le(s) package(s)... sous R. prevR et ses dépendances seront alors directement téléchargés et installés.

Sur la page de prevR sur CRAN, vous trouverez le manuel de référence des fonctions de prevR à la fois en anglais et en français.

Utilisez la commande require(prevR) pour charger prevR. demo(prevR) vous permet d’afficher une démonstration rapide des possibilités du package, ?prevR vous donne accès à l’aide en ligne en anglais et vignette('prevR-FR') vous permet d’afficher l’aide en français.

Des exemples de code et des fonctions additionnelles sont disponibles sur GitHub : https://github.com/larmarange/prevR-extra.

Forum de discussion

Un forum de discussion pour les utilisateurs de prevR est ouvert sur le site de l’auteur.

Notes

[1Licence libre de droit français développée par le CEA, le CNRS et l’INRIA.